BIO-BTE-10-L-4


Deutscher titel: Wissenschaftliche Programmierung für Biolog*innen (Projektarbeit)

English title: Scientific Programming For Biologists (project work)

KIS: BIO-BTE-10-L-4

Credit Points (CP): 9

Vorraussetzungen/Requirements: BIO-BTE-12-V-4

Table of contents

Kursbeschreibung(deutsch)

Setzen Sie Ihre Fähigkeiten mit einer individuellen Projektarbeit im Bereich der Bioinformatik in die Praxis um. Mögliche Projektthemen erstrecken sich über das gesamte Spektrum der Bioinformatik von Algorithmus- bis zur Webdienstimplementierung. Besprechen sie ihre eigene Themenidee oder wählen Sie ein vorgeschlagenes Projekt für sich aus.

Ablauf

  • Themenwahl: Die angebotenen Projektarbeitsthemen können sie der Sidebar links entnehmen. Die jeweiligen Artikel geben bereits einen detailierten Überblick über das Thema und verschiedene Hinweise und Tipps für deren Bearbeitung.

  • Themenbearbeitung: Nach einem Einführungsgespräch bearbeiten sie das Thema digital in Eigenregie. Die Literaturrecherche, das Suchen und Analysieren eventueller Referenzimplementationen, sowie das Implementieren ihrer Lösungen in F# sollten eigenständig durchgeführt werden. Wir stehen ihnen dabei natürlich bei technischen und/oder Verständnisproblemen zur Verfügung -

    [Optional] Um ihre Arbeit zu versionieren und leichter teilbar zu machen, empfiehlt sich die Einrichtung und Pflege eines Repositories auf GitHub. Bei Interesse kann hier auch eine Einführung unsererseits erfolgen.

  • Leistungsnachweis: Der Leistungsnachweis erfolgt durch eine Nachbesprechung und ein Protokoll mitsamt Dokumentation und Anwendungsbeispiel des Projekts. Art und Präsentation des Protokolls kann abhängig vom Projekt leicht unterschiedlich sein, grundsätzlich sollten Folgende Punkte aber immer beachtet werden:

    • Einleitender Text zu Problemstellung, Themenfeld, etc. (hier gerne an der Projektvorstellung orientieren)
    • Schritt-für-Schritt Erklärung der Implementation der Problemlösung mit Codebeispielen im Blogpost Stil

    • Anwendungsbeispiel mit Codebeispielen

Course description(english)

Put your skills into practice by working on an individual project work in the field of bioinformatics. Project topics span the range of bioinformatic application from algorithms to web service implementation. Discuss your own ideas as project topic or select a suggested project.

Procedure

coming soon